2023年11月7日上午，美国印第安纳大学黄昆教授受邀做客转化医学STAR论坛，作主题为“Computational Pathology and Integrative Genomics for Precision Medicine Research”的精彩报告。本次论坛由上海交通大学俞章盛教授主持，来自上海交通大学生命科学技术学院、转化医学研究院、电子信息与电气工程学院等多个单位的师生参加。

在报告中，黄昆教授着重介绍了计算病理学和基因组学综合分析的研究经验。癌症的发生与发展是一个复杂的生物学过程，研究这个过程需要对从分子到细胞、组织、器官直至临床各个层面上的数据进行收集和分析，以寻找可以准确预测癌症预后、分型和药物疗效的生物标志物，帮助临床医生选择正确的治疗策略。黄昆教授团队运用机器学习、深度学习等计算病理学方法，通过定量测量和多模态数据的整合分析，实现了在各个生物层面上的精确预测，同时指导了对深入病理机制的研究。在会议上，黄昆教授还分享了基于计算病理图像分析对癌症细胞与组织形态定量特征提取的一些方法以及将这些特征与多种类型的分子组学数据整合分析的近期工作。这些方法和工作已成功应用于多种癌症类型的研究，并为癌症的分子基础和肿瘤组织形态提出了新的假设。

报告最后，黄昆教授和与会师生就病理图像与基因数据的整合分析，计算病理学模型特征提取过程中的主要问题和可能的研究方向展开了热烈讨论。通过交流，增进了大家对多模态数据挖掘和计算病理学研究了解的广度与深度。

主讲人介绍

黄昆, 1996年毕业于清华大学，获生物学理学与电子计算机工学双学士学位， 后于美国伊利诺伊大学香槟校区(UIUC)获得生理学、电子工程和数学硕士学位，2004年获得电子与计算机工程学博士学位。2010年获俄亥俄州立大学终身教职。2017年加入印第安纳大学医学院，参与领导精准健康计划。现担任印第安纳大学医学院与Fairbanks公共卫生学院生物统计与健康数据科学系主任，基因组数据科学讲席教授，印第安纳大学Simon综合癌症中心副主任。2018年当选美国医学与生物工程学院(AIMBE)会士。主要研究方向包括生物信息学，医学图像分析，医疗大数据，机器学习及其在癌症研究及神经科学等方面的应用，在相关杂志和会议上发表研究论文250余篇。